Снейк Айз — таинственный и решительный воин, который оказывается вовлечён в судьбу древнего японского клана Арасикагэ. Его жизнь кардинально меняется, когда он спасает наследника этого клана, что приводит к тому, что его принимают в их ряды. В знак